MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 394

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017657	AAC	2	6	32	37	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017657	GGA	2	6	38	43	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017657	ACGG	2	8	456	463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017657	GGC	2	6	464	469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017657	GCC	2	6	473	478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017657	GCG	2	6	977	982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017657	CAC	2	6	1007	1012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017657	TTG	2	6	1021	1026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017657	CAG	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017657	GGT	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017657	GCA	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017657	GCC	2	6	1129	1134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017657	CG	3	6	1143	1148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017657	GGAAG	2	10	1176	1185	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017657	T	7	7	1242	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017657	TTC	3	9	1287	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017657	TCCTCT	2	12	1300	1311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017657	GCC	2	6	1460	1465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017657	CGT	2	6	1505	1510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017657	GCG	2	6	1512	1517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017657	GTT	2	6	1529	1534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017657	AG	4	8	1820	1827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017657	TGA	2	6	2134	2139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017657	TTG	2	6	2153	2158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017657	GGGA	2	8	2179	2186	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017657	T	6	6	2205	2210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017657	GTAA	2	8	3071	3078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017657	TAT	2	6	3109	3114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017657	TTC	2	6	3117	3122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017657	GTC	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017657	TCA	2	6	3155	3160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017657	AGG	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017657	TA	4	8	3234	3241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017657	CAGT	2	8	4716	4723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017657	TG	4	8	4746	4753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017657	AAT	2	6	5344	5349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017657	TGG	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017657	CAC	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017657	CAC	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017657	CT	3	6	5481	5486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017657	A	6	6	5498	5503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017657	ACA	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017657	GTA	2	6	5551	5556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017657	A	6	6	5571	5576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017657	ATT	2	6	5578	5583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017657	TGC	2	6	5596	5601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017657	GCG	2	6	5604	5609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017657	GT	3	6	5612	5617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017657	GCT	2	6	5643	5648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017657	TTTAT	2	10	5698	5707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017657	A	6	6	5712	5717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017657	ATTA	2	8	6187	6194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017657	ATTTGA	2	12	6216	6227	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017657	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017657	ATG	2	6	6660	6665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017657	A	6	6	6699	6704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017657	TGA	2	6	6715	6720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017657	AGA	2	6	6737	6742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017657	TGA	2	6	6748	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017657	TTC	2	6	6754	6759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017657	ATC	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017657	ATG	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017657	TA	3	6	6792	6797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017657	ACT	2	6	6882	6887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017657	TAA	2	6	6898	6903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017657	ATC	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017657	ATT	2	6	6945	6950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017657	TAA	2	6	6986	6991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017657	TAA	2	6	6997	7002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017657	TTTA	2	8	7018	7025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017657	ATT	2	6	7035	7040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017657	AGA	2	6	7062	7067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017657	AAG	2	6	7559	7564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017657	T	7	7	7568	7574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017657	CGG	2	6	9288	9293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017657	GAT	2	6	11312	11317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017657	GAG	2	6	11920	11925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017657	ATT	2	6	11988	11993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017657	ATA	2	6	12001	12006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017657	T	7	7	12302	12308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017657	T	6	6	12356	12361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017657	TG	3	6	12422	12427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017657	G	6	6	12440	12445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017657	AT	3	6	12493	12498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017657	TAT	2	6	12507	12512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017657	TTA	2	6	12924	12929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017657	AGC	2	6	12934	12939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017657	ATTA	2	8	13201	13208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017657	TC	3	6	13300	13305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017657	GAC	2	6	14170	14175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017657	GAG	2	6	14257	14262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017657	AT	3	6	14285	14290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017657	TAA	2	6	14307	14312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017657	TTA	2	6	14326	14331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017657	TTA	2	6	14333	14338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017657	TTA	2	6	14340	14345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017657	TTA	2	6	14347	14352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017657	TTA	2	6	14354	14359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017657	TTA	2	6	14361	14366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017657	TTA	2	6	14368	14373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017657	TTA	2	6	14375	14380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017657	TTA	2	6	14382	14387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017657	TTA	2	6	14389	14394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017657	TTAT	2	8	14396	14403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017657	TGGT	2	8	14417	14424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017657	A	8	8	14444	14451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017657	T	7	7	14504	14510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017657	TGTT	2	8	14542	14549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017657	AAG	2	6	14557	14562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017657	T	6	6	14578	14583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017657	AT	3	6	14604	14609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017657	AGA	2	6	14610	14615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017657	T	6	6	14634	14639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017657	GT	3	6	14669	14674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017657	A	6	6	14714	14719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017657	TAT	2	6	14736	14741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017657	CCA	2	6	17462	17467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017657	CGTTC	2	10	17488	17497	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017657	TTTTCC	2	12	20416	20427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017657	TGC	2	6	20447	20452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017657	TTC	2	6	23100	23105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017657	AACA	2	8	26052	26059	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017657	AGGC	2	8	26065	26072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017657	T	7	7	26077	26083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017657	GGA	2	6	26093	26098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017657	GGTT	2	8	26122	26129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017657	GGA	2	6	26135	26140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017657	GGC	2	6	26148	26153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017657	AGG	2	6	27798	27803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017657	TAA	2	6	28662	28667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017657	GGC	2	6	29300	29305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017657	AGA	2	6	29741	29746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017657	GCT	2	6	29748	29753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017657	TGG	2	6	29809	29814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017657	TTG	2	6	29871	29876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017657	CAG	2	6	29877	29882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017657	GAT	2	6	29891	29896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017657	A	6	6	29989	29994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017657	CTG	2	6	29995	30000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017657	GCA	2	6	30059	30064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017657	ACA	2	6	30122	30127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017657	A	6	6	30191	30196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017657	GTA	2	6	30199	30204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017657	GAG	2	6	30236	30241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017657	CGT	2	6	30554	30559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017657	CCT	2	6	30632	30637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_017657	AAT	2	6	30641	30646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017657	A	6	6	30694	30699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017657	CAC	2	6	30704	30709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_017657	A	6	6	30714	30719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017657	GCC	2	6	30866	30871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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155	NC_017657	GACA	2	8	30976	30983	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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167	NC_017657	TA	3	6	31511	31516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017657	AAT	2	6	32100	32105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_017657	AT	3	6	54261	54266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.